Hola Ainara, hemos estado es Santorini y en Mikonos y las visitas son muy fáciles.
Santorini:lo normal es que el barco se quede fondeado y os acerquen a tierra en los tenders, una vez allí hay tres formas de subir.
La mas económica es andando (no os la recomiendo por nada del mundo, aunque estemos en crisis), la segunda es montados en burro (te advierto que hay que hacer un curso de riesgos laborales, porque cuando veas el caminito con sus nosecuantos escalones por donde sube, salta y brinca el burrito te puede dar un jamacuco,ahhh y despues del paseo tienes que rociarte con alguna colonia fresquita para poder quitarte ese regusto a campo campero.Bueno y la tercera que me parece la mas adecuada es en funicular: seguro, limpio, con magnificas vistas y rápido tan sólo un par de minitos y creo recordar el precio son 4 € adultos y 2€ niños (parece que llevo comisión pero os recomiendo éste).El paseo por Santorini por sus calles estrechas y limpias es fantastico, está lleno de tiendas y restaurantes con magníficas vistas, desde donde se puede ver la parte volcanica.
Mikonos:lo normal es que el barco os ponga un bus lanzadera con el centro que está a unos 2 Km. (se puede ir andando pero normalmente hace mucho calor y la carretera es infernal, es muy estrecha, con muchas curvas y con un trafico de no te menees (no os recomiendo es paseo, porque ya paseareis mas tarde).El bus puede ser de pago o gratis segun la naviera, creo que a nosotros nos costó 6 euros (ida y vuelta).Una vez en Mikonos puedes pasear por sus calles, ver sus tiendas y tomarte algo en la infinidad de terrazas.Tambier visitar una cantidad de ermitas y por supuesto sus famosos molinos y si anda por allí y no está de descanso al famoso pelicano Petros que deambula por las calles a sus anchas.
Espero que todo este rollo os sirva para algo y estoy a vuestra disposición.
Saludos.